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nslookupコマンドで確認したところ、セカンダリはタイムアウトを起こしてました。
プライマリの/var/namedの中で該当していると思われるファイルを開き、シリアル番号を確認しました。
次のセカンダリのほうを見たところシリアル番号がちょっと違っていました。
このシリアル番号はプライマリもセカンダリも同じシリアル番号になるということでよろしいでしょうか？
例えば、規則として日付プラス整数2桁だった場合、
プライマリが2002080612となっていて、セカンダリのラストシリアル2002080713となっていたりするのは問題はないことでしょうか？
すみません、ご指導ください。

>セカンダリがアップデートされないという問題が起こるときは，
>シリアル番号を更新し忘れている，という原因が多いのですが，
>その辺はいかがでしょうか？
>
>>ネットや2000のヘルプで調べるとSetのオプションの使い方は出ているんですが。
>
>使っているのはbindではなく，Win 2000のDNSサーバですか？
>2000のDNSサーバは，Active Directoryにドメインの情報を登録することができ，
>その場合は，セカンダリの考え方がbindとは違います。
>2000のDNSサーバは複製の考え方にバリエーションがあり，
>説明すると長くなっちゃうので，
>『完全理解TCP/IPネットワーク』（日経BP社）の第3章，165ページ以後の
>解説を読んでもらった方がよいと思います。